Protein–RNA interactions for Protein: P36405

ARL3, ADP-ribosylation factor-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL3P36405 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ARL3P36405 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARL3P36405 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARL3P36405 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ARL3P36405 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARL3P36405 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARL3P36405 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARL3P36405 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARL3P36405 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARL3P36405 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARL3P36405 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARL3P36405 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARL3P36405 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARL3P36405 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARL3P36405 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARL3P36405 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARL3P36405 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARL3P36405 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARL3P36405 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL3P36405 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL3P36405 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL3P36405 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL3P36405 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL3P36405 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL3P36405 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL3P36405 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL3P36405 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL3P36405 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL3P36405 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL3P36405 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL3P36405 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL3P36405 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL3P36405 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL3P36405 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL3P36405 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL3P36405 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL3P36405 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL3P36405 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL3P36405 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL3P36405 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL3P36405 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL3P36405 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL3P36405 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL3P36405 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL3P36405 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL3P36405 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL3P36405 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL3P36405 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL3P36405 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL3P36405 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL3P36405 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL3P36405 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL3P36405 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL3P36405 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL3P36405 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL3P36405 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL3P36405 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL3P36405 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARL3P36405 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARL3P36405 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARL3P36405 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARL3P36405 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARL3P36405 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARL3P36405 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARL3P36405 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARL3P36405 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARL3P36405 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARL3P36405 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARL3P36405 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARL3P36405 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARL3P36405 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARL3P36405 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARL3P36405 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARL3P36405 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARL3P36405 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARL3P36405 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARL3P36405 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARL3P36405 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARL3P36405 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARL3P36405 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARL3P36405 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARL3P36405 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARL3P36405 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARL3P36405 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARL3P36405 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARL3P36405 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARL3P36405 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARL3P36405 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARL3P36405 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARL3P36405 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARL3P36405 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARL3P36405 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARL3P36405 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ARL3P36405 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARL3P36405 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARL3P36405 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARL3P36405 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARL3P36405 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARL3P36405 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ARL3P36405 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms