Protein–RNA interactions for Protein: P35268

RPL22, 60S ribosomal protein L22, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL22P35268 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL22P35268 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL22P35268 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL22P35268 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL22P35268 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL22P35268 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL22P35268 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL22P35268 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL22P35268 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RPL22P35268 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RPL22P35268 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPL22P35268 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPL22P35268 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPL22P35268 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RPL22P35268 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RPL22P35268 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RPL22P35268 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RPL22P35268 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RPL22P35268 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPL22P35268 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RPL22P35268 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL22P35268 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL22P35268 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RPL22P35268 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RPL22P35268 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL22P35268 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RPL22P35268 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL22P35268 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RPL22P35268 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RPL22P35268 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RPL22P35268 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL22P35268 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL22P35268 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RPL22P35268 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPL22P35268 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPL22P35268 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPL22P35268 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPL22P35268 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPL22P35268 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RPL22P35268 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RPL22P35268 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RPL22P35268 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPL22P35268 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RPL22P35268 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPL22P35268 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPL22P35268 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPL22P35268 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPL22P35268 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RPL22P35268 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL22P35268 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RPL22P35268 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RPL22P35268 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL22P35268 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL22P35268 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL22P35268 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL22P35268 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPL22P35268 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL22P35268 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL22P35268 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL22P35268 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL22P35268 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RPL22P35268 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL22P35268 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RPL22P35268 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL22P35268 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL22P35268 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL22P35268 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL22P35268 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL22P35268 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL22P35268 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL22P35268 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL22P35268 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL22P35268 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL22P35268 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL22P35268 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL22P35268 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RPL22P35268 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL22P35268 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RPL22P35268 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL22P35268 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL22P35268 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RPL22P35268 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RPL22P35268 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RPL22P35268 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RPL22P35268 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL22P35268 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL22P35268 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL22P35268 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL22P35268 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RPL22P35268 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RPL22P35268 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL22P35268 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL22P35268 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL22P35268 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL22P35268 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL22P35268 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL22P35268 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPL22P35268 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPL22P35268 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPL22P35268 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms