Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN7P35236 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPN7P35236 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPN7P35236 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPN7P35236 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPN7P35236 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPN7P35236 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPN7P35236 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms