Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GJA4P35212 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GJA4P35212 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GJA4P35212 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GJA4P35212 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GJA4P35212 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA4P35212 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA4P35212 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA4P35212 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA4P35212 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA4P35212 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA4P35212 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA4P35212 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA4P35212 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA4P35212 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA4P35212 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA4P35212 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA4P35212 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA4P35212 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA4P35212 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA4P35212 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA4P35212 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA4P35212 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA4P35212 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA4P35212 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA4P35212 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA4P35212 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA4P35212 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA4P35212 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA4P35212 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA4P35212 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA4P35212 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA4P35212 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA4P35212 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA4P35212 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA4P35212 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA4P35212 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA4P35212 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJA4P35212 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA4P35212 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA4P35212 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA4P35212 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA4P35212 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA4P35212 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA4P35212 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA4P35212 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA4P35212 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA4P35212 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA4P35212 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA4P35212 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA4P35212 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJA4P35212 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA4P35212 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA4P35212 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA4P35212 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA4P35212 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA4P35212 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA4P35212 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA4P35212 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA4P35212 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA4P35212 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA4P35212 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA4P35212 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA4P35212 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA4P35212 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA4P35212 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA4P35212 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA4P35212 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA4P35212 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA4P35212 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA4P35212 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA4P35212 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJA4P35212 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJA4P35212 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJA4P35212 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJA4P35212 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJA4P35212 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJA4P35212 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJA4P35212 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJA4P35212 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJA4P35212 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJA4P35212 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJA4P35212 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJA4P35212 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJA4P35212 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJA4P35212 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJA4P35212 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJA4P35212 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJA4P35212 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJA4P35212 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJA4P35212 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJA4P35212 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJA4P35212 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJA4P35212 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJA4P35212 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJA4P35212 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJA4P35212 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJA4P35212 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJA4P35212 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJA4P35212 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms