Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCKARP32238 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCKARP32238 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCKARP32238 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCKARP32238 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCKARP32238 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCKARP32238 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCKARP32238 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCKARP32238 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCKARP32238 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCKARP32238 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCKARP32238 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCKARP32238 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCKARP32238 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCKARP32238 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCKARP32238 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCKARP32238 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCKARP32238 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCKARP32238 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCKARP32238 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCKARP32238 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCKARP32238 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCKARP32238 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCKARP32238 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCKARP32238 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCKARP32238 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCKARP32238 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCKARP32238 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCKARP32238 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCKARP32238 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCKARP32238 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCKARP32238 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCKARP32238 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCKARP32238 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCKARP32238 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCKARP32238 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCKARP32238 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCKARP32238 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCKARP32238 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCKARP32238 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCKARP32238 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCKARP32238 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCKARP32238 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCKARP32238 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCKARP32238 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCKARP32238 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCKARP32238 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCKARP32238 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCKARP32238 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCKARP32238 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCKARP32238 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCKARP32238 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCKARP32238 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCKARP32238 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCKARP32238 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCKARP32238 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCKARP32238 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCKARP32238 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCKARP32238 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCKARP32238 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCKARP32238 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCKARP32238 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCKARP32238 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCKARP32238 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCKARP32238 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCKARP32238 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCKARP32238 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCKARP32238 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCKARP32238 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCKARP32238 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCKARP32238 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCKARP32238 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCKARP32238 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCKARP32238 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCKARP32238 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCKARP32238 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCKARP32238 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCKARP32238 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCKARP32238 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCKARP32238 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCKARP32238 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCKARP32238 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCKARP32238 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCKARP32238 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCKARP32238 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCKARP32238 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCKARP32238 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCKARP32238 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCKARP32238 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCKARP32238 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCKARP32238 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCKARP32238 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCKARP32238 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCKARP32238 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCKARP32238 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCKARP32238 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCKARP32238 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCKARP32238 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCKARP32238 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCKARP32238 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.6 ms