Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-DMAP28067 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms