Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NTF3P20783 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NTF3P20783 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NTF3P20783 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NTF3P20783 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NTF3P20783 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NTF3P20783 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NTF3P20783 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NTF3P20783 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NTF3P20783 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NTF3P20783 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NTF3P20783 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF3P20783 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF3P20783 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF3P20783 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF3P20783 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF3P20783 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF3P20783 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF3P20783 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF3P20783 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF3P20783 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF3P20783 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF3P20783 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF3P20783 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF3P20783 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF3P20783 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF3P20783 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF3P20783 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF3P20783 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF3P20783 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF3P20783 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF3P20783 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF3P20783 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF3P20783 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF3P20783 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF3P20783 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF3P20783 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF3P20783 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF3P20783 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF3P20783 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF3P20783 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF3P20783 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF3P20783 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF3P20783 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF3P20783 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF3P20783 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF3P20783 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF3P20783 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF3P20783 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NTF3P20783 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NTF3P20783 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NTF3P20783 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NTF3P20783 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NTF3P20783 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NTF3P20783 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NTF3P20783 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NTF3P20783 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NTF3P20783 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NTF3P20783 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NTF3P20783 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NTF3P20783 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NTF3P20783 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NTF3P20783 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NTF3P20783 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NTF3P20783 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NTF3P20783 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NTF3P20783 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NTF3P20783 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NTF3P20783 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NTF3P20783 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NTF3P20783 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NTF3P20783 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NTF3P20783 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NTF3P20783 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NTF3P20783 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NTF3P20783 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NTF3P20783 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NTF3P20783 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTF3P20783 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTF3P20783 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTF3P20783 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTF3P20783 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTF3P20783 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTF3P20783 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTF3P20783 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTF3P20783 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTF3P20783 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTF3P20783 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTF3P20783 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTF3P20783 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTF3P20783 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTF3P20783 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTF3P20783 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTF3P20783 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTF3P20783 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTF3P20783 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTF3P20783 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTF3P20783 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTF3P20783 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTF3P20783 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms