Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP4AP20648 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP4AP20648 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms