Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPI1P17947 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPI1P17947 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPI1P17947 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SPI1P17947 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPI1P17947 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPI1P17947 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SPI1P17947 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPI1P17947 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPI1P17947 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPI1P17947 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPI1P17947 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SPI1P17947 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPI1P17947 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPI1P17947 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPI1P17947 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPI1P17947 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPI1P17947 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPI1P17947 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPI1P17947 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPI1P17947 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPI1P17947 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPI1P17947 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPI1P17947 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPI1P17947 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPI1P17947 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPI1P17947 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPI1P17947 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SPI1P17947 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPI1P17947 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPI1P17947 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPI1P17947 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SPI1P17947 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPI1P17947 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPI1P17947 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPI1P17947 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPI1P17947 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPI1P17947 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPI1P17947 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPI1P17947 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPI1P17947 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SPI1P17947 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SPI1P17947 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPI1P17947 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPI1P17947 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPI1P17947 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPI1P17947 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPI1P17947 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPI1P17947 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPI1P17947 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPI1P17947 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPI1P17947 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPI1P17947 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPI1P17947 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPI1P17947 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPI1P17947 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPI1P17947 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPI1P17947 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPI1P17947 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPI1P17947 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPI1P17947 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPI1P17947 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPI1P17947 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPI1P17947 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPI1P17947 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPI1P17947 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPI1P17947 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPI1P17947 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPI1P17947 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPI1P17947 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPI1P17947 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPI1P17947 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SPI1P17947 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPI1P17947 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPI1P17947 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPI1P17947 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPI1P17947 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPI1P17947 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPI1P17947 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPI1P17947 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPI1P17947 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPI1P17947 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPI1P17947 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPI1P17947 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPI1P17947 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPI1P17947 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPI1P17947 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPI1P17947 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPI1P17947 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPI1P17947 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPI1P17947 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPI1P17947 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPI1P17947 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPI1P17947 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPI1P17947 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPI1P17947 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPI1P17947 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPI1P17947 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPI1P17947 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPI1P17947 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms