Protein–RNA interactions for Protein: P17029

ZKSCAN1, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN1P17029 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZKSCAN1P17029 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZKSCAN1P17029 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZKSCAN1P17029 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZKSCAN1P17029 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZKSCAN1P17029 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZKSCAN1P17029 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ZKSCAN1P17029 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ZKSCAN1P17029 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZKSCAN1P17029 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZKSCAN1P17029 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZKSCAN1P17029 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZKSCAN1P17029 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZKSCAN1P17029 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms