Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOA1P02647 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
APOA1P02647 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOA1P02647 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOA1P02647 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOA1P02647 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOA1P02647 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOA1P02647 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOA1P02647 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOA1P02647 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOA1P02647 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOA1P02647 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOA1P02647 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOA1P02647 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOA1P02647 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOA1P02647 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOA1P02647 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOA1P02647 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOA1P02647 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOA1P02647 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOA1P02647 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOA1P02647 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOA1P02647 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOA1P02647 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
APOA1P02647 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOA1P02647 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOA1P02647 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOA1P02647 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOA1P02647 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOA1P02647 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOA1P02647 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOA1P02647 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOA1P02647 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOA1P02647 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOA1P02647 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOA1P02647 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOA1P02647 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOA1P02647 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOA1P02647 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOA1P02647 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOA1P02647 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOA1P02647 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOA1P02647 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOA1P02647 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOA1P02647 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOA1P02647 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOA1P02647 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOA1P02647 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOA1P02647 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOA1P02647 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOA1P02647 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
APOA1P02647 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOA1P02647 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
APOA1P02647 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOA1P02647 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOA1P02647 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOA1P02647 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOA1P02647 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOA1P02647 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOA1P02647 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOA1P02647 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOA1P02647 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOA1P02647 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOA1P02647 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
APOA1P02647 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOA1P02647 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOA1P02647 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOA1P02647 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOA1P02647 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOA1P02647 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
APOA1P02647 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOA1P02647 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOA1P02647 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOA1P02647 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOA1P02647 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOA1P02647 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOA1P02647 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOA1P02647 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOA1P02647 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOA1P02647 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOA1P02647 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOA1P02647 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOA1P02647 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOA1P02647 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOA1P02647 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOA1P02647 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOA1P02647 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOA1P02647 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOA1P02647 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
APOA1P02647 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOA1P02647 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOA1P02647 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOA1P02647 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOA1P02647 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOA1P02647 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOA1P02647 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOA1P02647 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOA1P02647 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOA1P02647 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOA1P02647 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms