Protein–RNA interactions for Protein: P01008

SERPINC1, Antithrombin-III, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINC1P01008 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SERPINC1P01008 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SERPINC1P01008 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SERPINC1P01008 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms