Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG7O95352 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG7O95352 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG7O95352 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG7O95352 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG7O95352 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG7O95352 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG7O95352 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG7O95352 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG7O95352 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG7O95352 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG7O95352 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG7O95352 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG7O95352 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG7O95352 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG7O95352 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG7O95352 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG7O95352 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG7O95352 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG7O95352 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG7O95352 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG7O95352 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG7O95352 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG7O95352 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG7O95352 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG7O95352 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG7O95352 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG7O95352 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG7O95352 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG7O95352 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG7O95352 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG7O95352 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG7O95352 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG7O95352 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG7O95352 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG7O95352 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG7O95352 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG7O95352 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG7O95352 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG7O95352 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG7O95352 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG7O95352 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG7O95352 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG7O95352 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG7O95352 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG7O95352 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG7O95352 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG7O95352 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG7O95352 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG7O95352 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG7O95352 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG7O95352 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG7O95352 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG7O95352 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG7O95352 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG7O95352 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG7O95352 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG7O95352 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG7O95352 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG7O95352 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG7O95352 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG7O95352 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG7O95352 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG7O95352 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG7O95352 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG7O95352 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG7O95352 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG7O95352 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG7O95352 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG7O95352 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG7O95352 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG7O95352 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG7O95352 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG7O95352 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG7O95352 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG7O95352 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG7O95352 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG7O95352 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG7O95352 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG7O95352 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG7O95352 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG7O95352 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG7O95352 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG7O95352 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG7O95352 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG7O95352 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG7O95352 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG7O95352 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG7O95352 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG7O95352 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG7O95352 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG7O95352 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG7O95352 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG7O95352 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG7O95352 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG7O95352 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG7O95352 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG7O95352 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG7O95352 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG7O95352 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms