Protein–RNA interactions for Protein: O75564

JRK, Jerky protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JRKO75564 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
JRKO75564 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
JRKO75564 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
JRKO75564 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
JRKO75564 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
JRKO75564 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
JRKO75564 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
JRKO75564 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
JRKO75564 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
JRKO75564 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
JRKO75564 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
JRKO75564 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
JRKO75564 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
JRKO75564 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
JRKO75564 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
JRKO75564 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
JRKO75564 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
JRKO75564 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
JRKO75564 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
JRKO75564 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
JRKO75564 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
JRKO75564 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
JRKO75564 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
JRKO75564 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
JRKO75564 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
JRKO75564 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
JRKO75564 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
JRKO75564 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
JRKO75564 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
JRKO75564 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
JRKO75564 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
JRKO75564 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20■□□□□ 0.79
JRKO75564 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
JRKO75564 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
JRKO75564 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
JRKO75564 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
JRKO75564 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20■□□□□ 0.79
JRKO75564 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
JRKO75564 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
JRKO75564 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
JRKO75564 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
JRKO75564 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
JRKO75564 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
JRKO75564 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
JRKO75564 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
JRKO75564 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20■□□□□ 0.79
JRKO75564 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
JRKO75564 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
JRKO75564 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
JRKO75564 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
JRKO75564 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
JRKO75564 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
JRKO75564 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
JRKO75564 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
JRKO75564 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
JRKO75564 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
JRKO75564 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
JRKO75564 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
JRKO75564 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
JRKO75564 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
JRKO75564 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
JRKO75564 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
JRKO75564 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
JRKO75564 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
JRKO75564 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
JRKO75564 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
JRKO75564 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
JRKO75564 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
JRKO75564 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
JRKO75564 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
JRKO75564 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
JRKO75564 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
JRKO75564 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
JRKO75564 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
JRKO75564 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
JRKO75564 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
JRKO75564 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
JRKO75564 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
JRKO75564 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
JRKO75564 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
JRKO75564 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
JRKO75564 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
JRKO75564 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
JRKO75564 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
JRKO75564 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
JRKO75564 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
JRKO75564 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
JRKO75564 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
JRKO75564 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
JRKO75564 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
JRKO75564 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
JRKO75564 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
JRKO75564 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
JRKO75564 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
JRKO75564 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
JRKO75564 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
JRKO75564 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
JRKO75564 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
JRKO75564 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
JRKO75564 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms