Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ATG13O75143 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ATG13O75143 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ATG13O75143 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG13O75143 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG13O75143 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG13O75143 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG13O75143 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ATG13O75143 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATG13O75143 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATG13O75143 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATG13O75143 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG13O75143 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG13O75143 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG13O75143 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG13O75143 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG13O75143 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG13O75143 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG13O75143 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG13O75143 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG13O75143 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG13O75143 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG13O75143 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG13O75143 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG13O75143 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG13O75143 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG13O75143 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG13O75143 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG13O75143 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG13O75143 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG13O75143 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG13O75143 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG13O75143 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG13O75143 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG13O75143 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG13O75143 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG13O75143 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG13O75143 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG13O75143 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG13O75143 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG13O75143 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG13O75143 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG13O75143 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG13O75143 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG13O75143 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG13O75143 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG13O75143 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG13O75143 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG13O75143 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG13O75143 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG13O75143 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG13O75143 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG13O75143 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG13O75143 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG13O75143 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG13O75143 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG13O75143 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG13O75143 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG13O75143 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG13O75143 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG13O75143 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG13O75143 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG13O75143 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG13O75143 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG13O75143 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG13O75143 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG13O75143 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG13O75143 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG13O75143 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG13O75143 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG13O75143 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG13O75143 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG13O75143 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG13O75143 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG13O75143 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG13O75143 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG13O75143 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG13O75143 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG13O75143 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG13O75143 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG13O75143 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG13O75143 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG13O75143 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG13O75143 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG13O75143 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG13O75143 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG13O75143 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG13O75143 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG13O75143 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG13O75143 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG13O75143 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG13O75143 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG13O75143 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG13O75143 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG13O75143 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG13O75143 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG13O75143 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG13O75143 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG13O75143 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG13O75143 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms