Protein–RNA interactions for Protein: O14730

RIOK3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK3O14730 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RIOK3O14730 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIOK3O14730 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIOK3O14730 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIOK3O14730 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIOK3O14730 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIOK3O14730 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms