Protein–RNA interactions for Protein: E2RYF7

HCG22, Protein PBMUCL2, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG22E2RYF7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
HCG22E2RYF7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
HCG22E2RYF7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
HCG22E2RYF7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
HCG22E2RYF7 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
HCG22E2RYF7 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
HCG22E2RYF7 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
HCG22E2RYF7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
HCG22E2RYF7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
HCG22E2RYF7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
HCG22E2RYF7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
HCG22E2RYF7 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
HCG22E2RYF7 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
HCG22E2RYF7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
HCG22E2RYF7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HCG22E2RYF7 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HCG22E2RYF7 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HCG22E2RYF7 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HCG22E2RYF7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
HCG22E2RYF7 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HCG22E2RYF7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HCG22E2RYF7 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HCG22E2RYF7 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HCG22E2RYF7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HCG22E2RYF7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HCG22E2RYF7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HCG22E2RYF7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HCG22E2RYF7 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HCG22E2RYF7 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HCG22E2RYF7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HCG22E2RYF7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HCG22E2RYF7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HCG22E2RYF7 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HCG22E2RYF7 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HCG22E2RYF7 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HCG22E2RYF7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HCG22E2RYF7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HCG22E2RYF7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HCG22E2RYF7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HCG22E2RYF7 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HCG22E2RYF7 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HCG22E2RYF7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HCG22E2RYF7 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HCG22E2RYF7 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HCG22E2RYF7 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HCG22E2RYF7 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HCG22E2RYF7 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HCG22E2RYF7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HCG22E2RYF7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HCG22E2RYF7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HCG22E2RYF7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HCG22E2RYF7 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HCG22E2RYF7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HCG22E2RYF7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HCG22E2RYF7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HCG22E2RYF7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HCG22E2RYF7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
HCG22E2RYF7 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HCG22E2RYF7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HCG22E2RYF7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HCG22E2RYF7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HCG22E2RYF7 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HCG22E2RYF7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HCG22E2RYF7 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HCG22E2RYF7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HCG22E2RYF7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HCG22E2RYF7 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
HCG22E2RYF7 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
HCG22E2RYF7 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
HCG22E2RYF7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HCG22E2RYF7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HCG22E2RYF7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HCG22E2RYF7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HCG22E2RYF7 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HCG22E2RYF7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HCG22E2RYF7 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HCG22E2RYF7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HCG22E2RYF7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HCG22E2RYF7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HCG22E2RYF7 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HCG22E2RYF7 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HCG22E2RYF7 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HCG22E2RYF7 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HCG22E2RYF7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HCG22E2RYF7 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HCG22E2RYF7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HCG22E2RYF7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HCG22E2RYF7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HCG22E2RYF7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HCG22E2RYF7 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HCG22E2RYF7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HCG22E2RYF7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HCG22E2RYF7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HCG22E2RYF7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HCG22E2RYF7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HCG22E2RYF7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HCG22E2RYF7 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HCG22E2RYF7 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HCG22E2RYF7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HCG22E2RYF7 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms