Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
STRCP1A6NGW2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
STRCP1A6NGW2 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
STRCP1A6NGW2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
STRCP1A6NGW2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
STRCP1A6NGW2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
STRCP1A6NGW2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
STRCP1A6NGW2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
STRCP1A6NGW2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
STRCP1A6NGW2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
STRCP1A6NGW2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
STRCP1A6NGW2 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
STRCP1A6NGW2 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
STRCP1A6NGW2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
STRCP1A6NGW2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
STRCP1A6NGW2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
STRCP1A6NGW2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
STRCP1A6NGW2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
STRCP1A6NGW2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
STRCP1A6NGW2 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
STRCP1A6NGW2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
STRCP1A6NGW2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
STRCP1A6NGW2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
STRCP1A6NGW2 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
STRCP1A6NGW2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
STRCP1A6NGW2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
STRCP1A6NGW2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
STRCP1A6NGW2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
STRCP1A6NGW2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
STRCP1A6NGW2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
STRCP1A6NGW2 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
STRCP1A6NGW2 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
STRCP1A6NGW2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
STRCP1A6NGW2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
STRCP1A6NGW2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
STRCP1A6NGW2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
STRCP1A6NGW2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
STRCP1A6NGW2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
STRCP1A6NGW2 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
STRCP1A6NGW2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
STRCP1A6NGW2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
STRCP1A6NGW2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
STRCP1A6NGW2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
STRCP1A6NGW2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
STRCP1A6NGW2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
STRCP1A6NGW2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
STRCP1A6NGW2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
STRCP1A6NGW2 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
STRCP1A6NGW2 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
STRCP1A6NGW2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
STRCP1A6NGW2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
STRCP1A6NGW2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
STRCP1A6NGW2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
STRCP1A6NGW2 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
STRCP1A6NGW2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
STRCP1A6NGW2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
STRCP1A6NGW2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
STRCP1A6NGW2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
STRCP1A6NGW2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
STRCP1A6NGW2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
STRCP1A6NGW2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
STRCP1A6NGW2 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
STRCP1A6NGW2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
STRCP1A6NGW2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
STRCP1A6NGW2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
STRCP1A6NGW2 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
STRCP1A6NGW2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
STRCP1A6NGW2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
STRCP1A6NGW2 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
STRCP1A6NGW2 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
STRCP1A6NGW2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
STRCP1A6NGW2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
STRCP1A6NGW2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
STRCP1A6NGW2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
STRCP1A6NGW2 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
STRCP1A6NGW2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
STRCP1A6NGW2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
STRCP1A6NGW2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
STRCP1A6NGW2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
STRCP1A6NGW2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
STRCP1A6NGW2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
STRCP1A6NGW2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
STRCP1A6NGW2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
STRCP1A6NGW2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
STRCP1A6NGW2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
STRCP1A6NGW2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
STRCP1A6NGW2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
STRCP1A6NGW2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
STRCP1A6NGW2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
STRCP1A6NGW2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
STRCP1A6NGW2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
STRCP1A6NGW2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
STRCP1A6NGW2 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
STRCP1A6NGW2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
STRCP1A6NGW2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
STRCP1A6NGW2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
STRCP1A6NGW2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
STRCP1A6NGW2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
STRCP1A6NGW2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
STRCP1A6NGW2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms