Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1E9

TRBV7-7, T-cell receptor beta variable 7-7 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-7A0A0K0K1E9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV7-7A0A0K0K1E9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV7-7A0A0K0K1E9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV7-7A0A0K0K1E9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV7-7A0A0K0K1E9 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV7-7A0A0K0K1E9 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV7-7A0A0K0K1E9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV7-7A0A0K0K1E9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV7-7A0A0K0K1E9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV7-7A0A0K0K1E9 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV7-7A0A0K0K1E9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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TRBV7-7A0A0K0K1E9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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TRBV7-7A0A0K0K1E9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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TRBV7-7A0A0K0K1E9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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TRBV7-7A0A0K0K1E9 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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TRBV7-7A0A0K0K1E9 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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TRBV7-7A0A0K0K1E9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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TRBV7-7A0A0K0K1E9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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