Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
A3GALT2U3KPV4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms