Protein–RNA interactions for Protein: S4R3C0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S4R3C0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
S4R3C0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
S4R3C0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
S4R3C0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
S4R3C0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
S4R3C0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
S4R3C0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
S4R3C0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
S4R3C0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
S4R3C0 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
S4R3C0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
S4R3C0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
S4R3C0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
S4R3C0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
S4R3C0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
S4R3C0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
S4R3C0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
S4R3C0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
S4R3C0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
S4R3C0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
S4R3C0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
S4R3C0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
S4R3C0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
S4R3C0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
S4R3C0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
S4R3C0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
S4R3C0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
S4R3C0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
S4R3C0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
S4R3C0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
S4R3C0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
S4R3C0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
S4R3C0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
S4R3C0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
S4R3C0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
S4R3C0 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
S4R3C0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
S4R3C0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
S4R3C0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
S4R3C0 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
S4R3C0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
S4R3C0 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
S4R3C0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
S4R3C0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
S4R3C0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
S4R3C0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
S4R3C0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
S4R3C0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
S4R3C0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
S4R3C0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
S4R3C0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
S4R3C0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
S4R3C0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
S4R3C0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
S4R3C0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
S4R3C0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
S4R3C0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
S4R3C0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
S4R3C0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
S4R3C0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
S4R3C0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
S4R3C0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
S4R3C0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
S4R3C0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
S4R3C0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
S4R3C0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
S4R3C0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
S4R3C0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
S4R3C0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
S4R3C0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
S4R3C0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
S4R3C0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
S4R3C0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
S4R3C0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
S4R3C0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
S4R3C0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
S4R3C0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
S4R3C0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
S4R3C0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
S4R3C0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
S4R3C0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
S4R3C0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
S4R3C0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
S4R3C0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
S4R3C0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
S4R3C0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
S4R3C0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
S4R3C0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
S4R3C0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
S4R3C0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
S4R3C0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
S4R3C0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
S4R3C0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
S4R3C0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
S4R3C0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
S4R3C0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
S4R3C0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
S4R3C0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
S4R3C0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
S4R3C0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms