Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J7

TIMM9, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim9, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM9Q9Y5J7 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TIMM9Q9Y5J7 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TIMM9Q9Y5J7 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TIMM9Q9Y5J7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TIMM9Q9Y5J7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TIMM9Q9Y5J7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms