Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms