Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
R3HCC1Q9Y3T6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
R3HCC1Q9Y3T6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
R3HCC1Q9Y3T6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
R3HCC1Q9Y3T6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
R3HCC1Q9Y3T6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
R3HCC1Q9Y3T6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
R3HCC1Q9Y3T6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
R3HCC1Q9Y3T6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
R3HCC1Q9Y3T6 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
R3HCC1Q9Y3T6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
R3HCC1Q9Y3T6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
R3HCC1Q9Y3T6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
R3HCC1Q9Y3T6 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
R3HCC1Q9Y3T6 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
R3HCC1Q9Y3T6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
R3HCC1Q9Y3T6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
R3HCC1Q9Y3T6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
R3HCC1Q9Y3T6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
R3HCC1Q9Y3T6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
R3HCC1Q9Y3T6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
R3HCC1Q9Y3T6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
R3HCC1Q9Y3T6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
R3HCC1Q9Y3T6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
R3HCC1Q9Y3T6 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
R3HCC1Q9Y3T6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
R3HCC1Q9Y3T6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
R3HCC1Q9Y3T6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
R3HCC1Q9Y3T6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
R3HCC1Q9Y3T6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
R3HCC1Q9Y3T6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
R3HCC1Q9Y3T6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
R3HCC1Q9Y3T6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
R3HCC1Q9Y3T6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
R3HCC1Q9Y3T6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
R3HCC1Q9Y3T6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
R3HCC1Q9Y3T6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
R3HCC1Q9Y3T6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
R3HCC1Q9Y3T6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
R3HCC1Q9Y3T6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
R3HCC1Q9Y3T6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
R3HCC1Q9Y3T6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
R3HCC1Q9Y3T6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
R3HCC1Q9Y3T6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
R3HCC1Q9Y3T6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
R3HCC1Q9Y3T6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
R3HCC1Q9Y3T6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
R3HCC1Q9Y3T6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
R3HCC1Q9Y3T6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
R3HCC1Q9Y3T6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
R3HCC1Q9Y3T6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
R3HCC1Q9Y3T6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
R3HCC1Q9Y3T6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
R3HCC1Q9Y3T6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
R3HCC1Q9Y3T6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
R3HCC1Q9Y3T6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
R3HCC1Q9Y3T6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
R3HCC1Q9Y3T6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
R3HCC1Q9Y3T6 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
R3HCC1Q9Y3T6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
R3HCC1Q9Y3T6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
R3HCC1Q9Y3T6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
R3HCC1Q9Y3T6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
R3HCC1Q9Y3T6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
R3HCC1Q9Y3T6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
R3HCC1Q9Y3T6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms