Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIGD1AQ9Y241 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms