Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU9

NXF1, Nuclear RNA export factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF1Q9UBU9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NXF1Q9UBU9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms