Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE8

NLK, Serine/threonine-protein kinase NLK, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLKQ9UBE8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms