Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBM28Q9NW13 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms