Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVH6

TMLHE, Trimethyllysine dioxygenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMLHEQ9NVH6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMLHEQ9NVH6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMLHEQ9NVH6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMLHEQ9NVH6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMLHEQ9NVH6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMLHEQ9NVH6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMLHEQ9NVH6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMLHEQ9NVH6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMLHEQ9NVH6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMLHEQ9NVH6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMLHEQ9NVH6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMLHEQ9NVH6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMLHEQ9NVH6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMLHEQ9NVH6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMLHEQ9NVH6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMLHEQ9NVH6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMLHEQ9NVH6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMLHEQ9NVH6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMLHEQ9NVH6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TMLHEQ9NVH6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMLHEQ9NVH6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMLHEQ9NVH6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMLHEQ9NVH6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMLHEQ9NVH6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMLHEQ9NVH6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TMLHEQ9NVH6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMLHEQ9NVH6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMLHEQ9NVH6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMLHEQ9NVH6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMLHEQ9NVH6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMLHEQ9NVH6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMLHEQ9NVH6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMLHEQ9NVH6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMLHEQ9NVH6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMLHEQ9NVH6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMLHEQ9NVH6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMLHEQ9NVH6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TMLHEQ9NVH6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMLHEQ9NVH6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMLHEQ9NVH6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMLHEQ9NVH6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMLHEQ9NVH6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMLHEQ9NVH6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMLHEQ9NVH6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMLHEQ9NVH6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMLHEQ9NVH6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMLHEQ9NVH6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMLHEQ9NVH6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMLHEQ9NVH6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMLHEQ9NVH6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMLHEQ9NVH6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMLHEQ9NVH6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMLHEQ9NVH6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TMLHEQ9NVH6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMLHEQ9NVH6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMLHEQ9NVH6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMLHEQ9NVH6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMLHEQ9NVH6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMLHEQ9NVH6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMLHEQ9NVH6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TMLHEQ9NVH6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMLHEQ9NVH6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMLHEQ9NVH6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMLHEQ9NVH6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TMLHEQ9NVH6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMLHEQ9NVH6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMLHEQ9NVH6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TMLHEQ9NVH6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMLHEQ9NVH6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TMLHEQ9NVH6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMLHEQ9NVH6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMLHEQ9NVH6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMLHEQ9NVH6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMLHEQ9NVH6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMLHEQ9NVH6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMLHEQ9NVH6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMLHEQ9NVH6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMLHEQ9NVH6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMLHEQ9NVH6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMLHEQ9NVH6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMLHEQ9NVH6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMLHEQ9NVH6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMLHEQ9NVH6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMLHEQ9NVH6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMLHEQ9NVH6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMLHEQ9NVH6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMLHEQ9NVH6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMLHEQ9NVH6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMLHEQ9NVH6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMLHEQ9NVH6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMLHEQ9NVH6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMLHEQ9NVH6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMLHEQ9NVH6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMLHEQ9NVH6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMLHEQ9NVH6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMLHEQ9NVH6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMLHEQ9NVH6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMLHEQ9NVH6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMLHEQ9NVH6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMLHEQ9NVH6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms