Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms