Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 CRADD-210ENST00000552033 622 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.068e-21■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 KLF11-202ENST00000401510 614 ntTSL 38.4□□□□□ -1.067e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.078e-21■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 RPL27-202ENST00000586277 460 ntTSL 38.29□□□□□ -1.087e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 GIGYF2-231ENST00000474312 4687 ntTSL 28.27□□□□□ -1.093e-14■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 EHBP1-207ENST00000426940 586 ntTSL 48.27□□□□□ -1.095e-8■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 AP3S2-208ENST00000558999 653 ntTSL 58.26□□□□□ -1.097e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 SPART-208ENST00000491805 668 ntTSL 28.25□□□□□ -1.097e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 TDRD3-209ENST00000621840 2497 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.117e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 DUS2-212ENST00000569289 373 ntTSL 58.08□□□□□ -1.127e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 UBR3-205ENST00000439681 2183 ntTSL 28.07□□□□□ -1.127e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 ANO10-210ENST00000439141 560 ntTSL 48.04□□□□□ -1.127e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.147e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 BTRC-205ENST00000465182 685 ntTSL 37.91□□□□□ -1.147e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 PRIMPOL-210ENST00000515152 784 ntTSL 37.82□□□□□ -1.167e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 SLC25A12-203ENST00000426896 911 ntTSL 27.69□□□□□ -1.187e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 TRIM4-204ENST00000447480 639 ntTSL 37.67□□□□□ -1.187e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 CCDC91-209ENST00000539904 989 ntTSL 57.57□□□□□ -1.27e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 LEF1-206ENST00000504775 860 ntTSL 57.57□□□□□ -1.27e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 PSMB3-212ENST00000620309 552 ntTSL 27.55□□□□□ -1.27e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 ACSBG2-209ENST00000590132 683 ntTSL 47.51□□□□□ -1.217e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 LEF1-207ENST00000504950 572 ntTSL 57.5□□□□□ -1.217e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 DUS2-214ENST00000571081 570 ntTSL 47.49□□□□□ -1.217e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 AL451165.2-202ENST00000606496 365 ntTSL 27.45□□□□□ -1.227e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.227e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 GFPT1-204ENST00000494201 625 ntTSL 57.36□□□□□ -1.237e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 MGST2-201ENST00000265498 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.248e-21■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 PVT1-217ENST00000523190 443 ntTSL 37.28□□□□□ -1.243e-9■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 AP3S2-214ENST00000560940 519 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.257e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 AP3S2-210ENST00000559601 543 ntTSL 47.17□□□□□ -1.267e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 AP3S2-212ENST00000560251 573 ntTSL 47.17□□□□□ -1.267e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 ZNF418-204ENST00000595569 560 ntTSL 47.08□□□□□ -1.287e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 UBR3-207ENST00000465630 576 ntTSL 47.06□□□□□ -1.287e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 KLHL23-204ENST00000448589 594 ntTSL 27.02□□□□□ -1.297e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.37e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 CACNA1A-203ENST00000573891 896 ntTSL 56.91□□□□□ -1.37e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.317e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.327e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 ZNF330-202ENST00000503649 573 ntTSL 56.8□□□□□ -1.327e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.337e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 TNPO1-209ENST00000513944 569 ntTSL 46.7□□□□□ -1.348e-21■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 EHBP1-219ENST00000494958 1127 ntTSL 1 (best)6.67□□□□□ -1.345e-8■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 ANO10-204ENST00000413397 511 ntTSL 46.5□□□□□ -1.377e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 LEF1-217ENST00000510717 568 ntTSL 46.34□□□□□ -1.397e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.417e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 AC073585.1-202ENST00000425266 468 ntTSL 26.12□□□□□ -1.437e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.437e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 MGST2-205ENST00000515067 437 ntTSL 36.1□□□□□ -1.438e-21■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.443e-6■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.463e-6■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 CLSTN3-215ENST00000544584 546 ntTSL 45.94□□□□□ -1.467e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.487e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 GAB1-210ENST00000511836 571 ntTSL 25.79□□□□□ -1.487e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.482e-8■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 ZNF418-203ENST00000593296 543 ntTSL 45.61□□□□□ -1.517e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 ARFGEF1-207ENST00000520381 5882 ntTSL 55.47□□□□□ -1.538e-21■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.547e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 GTDC1-209ENST00000417450 601 ntTSL 45.35□□□□□ -1.558e-7■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 PPIG-204ENST00000417938 527 ntTSL 55.31□□□□□ -1.567e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.577e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 UBR3-206ENST00000444475 3821 ntTSL 55.14□□□□□ -1.597e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 GAB1-213ENST00000515366 582 ntTSL 45.12□□□□□ -1.597e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 ANKRD28-209ENST00000476472 594 ntTSL 44.91□□□□□ -1.627e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 PSMB3-209ENST00000614132 426 ntTSL 24.9□□□□□ -1.637e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 TBL1XR1-233ENST00000637659 3105 ntTSL 54.86□□□□□ -1.638e-21■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 AP3S2-211ENST00000560184 601 ntTSL 34.86□□□□□ -1.637e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 ANKRD28-205ENST00000460278 557 ntTSL 44.83□□□□□ -1.647e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.667e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 UBR3-208ENST00000474426 4066 ntTSL 1 (best)4.53□□□□□ -1.687e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC4.52□□□□□ -1.697e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 A2ML1-204ENST00000537546 560 ntTSL 44.34□□□□□ -1.717e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 GGH-207ENST00000523479 413 ntTSL 54.33□□□□□ -1.727e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.782e-8■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 FAM27E5-202ENST00000613377 216 ntTSL 53.91□□□□□ -1.787e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 MRPS27-208ENST00000519143 298 ntTSL 53.62□□□□□ -1.837e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 DMD-219ENST00000471779 362 ntTSL 1 (best)3.04□□□□□ -1.927e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.957e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.761e-6■■■■■ 260.6
UTP3Q9NQZ2 SF1-211ENST00000448404 2778 ntTSL 1 (best)16.37■□□□□ 0.211e-6■■■■■ 260.6
UTP3Q9NQZ2 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.011e-6■■■■■ 260.6
UTP3Q9NQZ2 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.011e-6■■■■■ 260.6
UTP3Q9NQZ2 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.041e-6■■■■■ 260.6
UTP3Q9NQZ2 SF1-204ENST00000377390 3470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.291e-6■■■■■ 260.6
UTP3Q9NQZ2 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.187e-7■■■■■ 260.5
UTP3Q9NQZ2 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.17e-7■■■■■ 260.5
UTP3Q9NQZ2 SUGP2-206ENST00000594773 4169 ntTSL 210.7□□□□□ -0.77e-7■■■■■ 260.5
UTP3Q9NQZ2 SUGP2-201ENST00000330854 3629 ntTSL 1 (best)10.64□□□□□ -0.717e-7■■■■■ 260.5
UTP3Q9NQZ2 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.263e-8■■■■■ 260.4
UTP3Q9NQZ2 ARL6IP4-219ENST00000542099 1119 ntTSL 324.62■■□□□ 1.532e-10■■■■■ 260.3
UTP3Q9NQZ2 ARL6IP4-206ENST00000413381 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 514.2□□□□□ -0.142e-10■■■■■ 260.3
UTP3Q9NQZ2 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.294e-7■■■■■ 259.9
UTP3Q9NQZ2 DNAAF5-205ENST00000440747 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 219.92■□□□□ 0.782e-6■■■■■ 259.8
UTP3Q9NQZ2 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.412e-6■■■■■ 259.8
UTP3Q9NQZ2 PRRC2B-204ENST00000422467 535 ntTSL 512.88□□□□□ -0.354e-7■■■■■ 259.6
UTP3Q9NQZ2 CTNNA3-204ENST00000494580 470 ntTSL 35.71□□□□□ -1.58e-12■■■■■ 259.6
UTP3Q9NQZ2 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.588e-12■■■■■ 259.6
UTP3Q9NQZ2 TESC-208ENST00000552139 307 ntTSL 222.28■■□□□ 1.168e-7■■■■■ 259.2
UTP3Q9NQZ2 NECAB3-217ENST00000606106 591 ntTSL 420.8■□□□□ 0.921e-7■■■■■ 259.2
UTP3Q9NQZ2 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.892e-6■■■■■ 258.4
UTP3Q9NQZ2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.832e-6■■■■■ 258.4
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 590.6 ms