Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MEPEQ9NQ76 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MEPEQ9NQ76 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MEPEQ9NQ76 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MEPEQ9NQ76 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MEPEQ9NQ76 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MEPEQ9NQ76 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MEPEQ9NQ76 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MEPEQ9NQ76 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MEPEQ9NQ76 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MEPEQ9NQ76 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MEPEQ9NQ76 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MEPEQ9NQ76 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MEPEQ9NQ76 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MEPEQ9NQ76 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MEPEQ9NQ76 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MEPEQ9NQ76 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MEPEQ9NQ76 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MEPEQ9NQ76 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MEPEQ9NQ76 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MEPEQ9NQ76 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms