Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCL3Q9H2J4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDCL3Q9H2J4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms