Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0T7

RAB17, Ras-related protein Rab-17, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB17Q9H0T7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB17Q9H0T7 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB17Q9H0T7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB17Q9H0T7 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB17Q9H0T7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB17Q9H0T7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB17Q9H0T7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB17Q9H0T7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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