Protein–RNA interactions for Protein: Q9C029

TRIM7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM7Q9C029 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM7Q9C029 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms