Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMIM3Q9BZL3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms