Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms