Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBB2BQ9BVA1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms