Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms