Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR3CQ9BUI4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR3CQ9BUI4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms