Protein–RNA interactions for Protein: Q99456

KRT12, Keratin, type I cytoskeletal 12, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT12Q99456 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT12Q99456 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT12Q99456 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms