Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
TRAPPC9Q96Q05 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC9Q96Q05 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms