Protein–RNA interactions for Protein: Q96NR8

RDH12, Retinol dehydrogenase 12, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH12Q96NR8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RDH12Q96NR8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RDH12Q96NR8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RDH12Q96NR8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RDH12Q96NR8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RDH12Q96NR8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RDH12Q96NR8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RDH12Q96NR8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RDH12Q96NR8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RDH12Q96NR8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RDH12Q96NR8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RDH12Q96NR8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RDH12Q96NR8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RDH12Q96NR8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RDH12Q96NR8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RDH12Q96NR8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RDH12Q96NR8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RDH12Q96NR8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RDH12Q96NR8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RDH12Q96NR8 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms