Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW5

COG8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG8Q96MW5 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COG8Q96MW5 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms