Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CFAP53Q96M91 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CFAP53Q96M91 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CFAP53Q96M91 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CFAP53Q96M91 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CFAP53Q96M91 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CFAP53Q96M91 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CFAP53Q96M91 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CFAP53Q96M91 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CFAP53Q96M91 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CFAP53Q96M91 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CFAP53Q96M91 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CFAP53Q96M91 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CFAP53Q96M91 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CFAP53Q96M91 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CFAP53Q96M91 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CFAP53Q96M91 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CFAP53Q96M91 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CFAP53Q96M91 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CFAP53Q96M91 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFAP53Q96M91 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFAP53Q96M91 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFAP53Q96M91 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFAP53Q96M91 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFAP53Q96M91 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFAP53Q96M91 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFAP53Q96M91 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFAP53Q96M91 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFAP53Q96M91 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFAP53Q96M91 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFAP53Q96M91 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFAP53Q96M91 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFAP53Q96M91 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFAP53Q96M91 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFAP53Q96M91 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFAP53Q96M91 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFAP53Q96M91 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFAP53Q96M91 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFAP53Q96M91 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFAP53Q96M91 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFAP53Q96M91 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFAP53Q96M91 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFAP53Q96M91 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFAP53Q96M91 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFAP53Q96M91 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFAP53Q96M91 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFAP53Q96M91 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CFAP53Q96M91 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CFAP53Q96M91 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CFAP53Q96M91 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CFAP53Q96M91 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CFAP53Q96M91 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CFAP53Q96M91 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CFAP53Q96M91 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CFAP53Q96M91 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CFAP53Q96M91 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CFAP53Q96M91 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CFAP53Q96M91 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CFAP53Q96M91 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms