Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC7Q96M83 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC7Q96M83 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC7Q96M83 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC7Q96M83 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC7Q96M83 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC7Q96M83 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC7Q96M83 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC7Q96M83 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC7Q96M83 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC7Q96M83 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC7Q96M83 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC7Q96M83 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC7Q96M83 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC7Q96M83 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC7Q96M83 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC7Q96M83 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC7Q96M83 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC7Q96M83 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC7Q96M83 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC7Q96M83 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC7Q96M83 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC7Q96M83 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC7Q96M83 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC7Q96M83 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC7Q96M83 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC7Q96M83 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC7Q96M83 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC7Q96M83 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC7Q96M83 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC7Q96M83 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC7Q96M83 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC7Q96M83 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC7Q96M83 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC7Q96M83 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC7Q96M83 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC7Q96M83 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC7Q96M83 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC7Q96M83 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC7Q96M83 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC7Q96M83 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC7Q96M83 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC7Q96M83 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC7Q96M83 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC7Q96M83 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC7Q96M83 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC7Q96M83 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC7Q96M83 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC7Q96M83 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC7Q96M83 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC7Q96M83 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC7Q96M83 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC7Q96M83 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC7Q96M83 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC7Q96M83 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC7Q96M83 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC7Q96M83 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC7Q96M83 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC7Q96M83 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC7Q96M83 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC7Q96M83 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC7Q96M83 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC7Q96M83 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC7Q96M83 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC7Q96M83 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC7Q96M83 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC7Q96M83 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC7Q96M83 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC7Q96M83 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC7Q96M83 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC7Q96M83 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC7Q96M83 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC7Q96M83 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC7Q96M83 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC7Q96M83 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC7Q96M83 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC7Q96M83 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC7Q96M83 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC7Q96M83 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC7Q96M83 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC7Q96M83 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC7Q96M83 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC7Q96M83 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC7Q96M83 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC7Q96M83 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC7Q96M83 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC7Q96M83 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC7Q96M83 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC7Q96M83 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC7Q96M83 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC7Q96M83 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC7Q96M83 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC7Q96M83 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC7Q96M83 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC7Q96M83 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC7Q96M83 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC7Q96M83 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC7Q96M83 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC7Q96M83 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC7Q96M83 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms