Protein–RNA interactions for Protein: Q96KP6

TNIP3, TNFAIP3-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP3Q96KP6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNIP3Q96KP6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms