Protein–RNA interactions for Protein: Q96E11

MRRF, Ribosome-recycling factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRRFQ96E11 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRRFQ96E11 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRRFQ96E11 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRRFQ96E11 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRRFQ96E11 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRRFQ96E11 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MRRFQ96E11 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRRFQ96E11 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRRFQ96E11 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRRFQ96E11 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRRFQ96E11 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRRFQ96E11 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRRFQ96E11 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRRFQ96E11 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRRFQ96E11 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MRRFQ96E11 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRRFQ96E11 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRRFQ96E11 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRRFQ96E11 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRRFQ96E11 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRRFQ96E11 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRRFQ96E11 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRRFQ96E11 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRRFQ96E11 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRRFQ96E11 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRRFQ96E11 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRRFQ96E11 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRRFQ96E11 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRRFQ96E11 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRRFQ96E11 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRRFQ96E11 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
MRRFQ96E11 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRRFQ96E11 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRRFQ96E11 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRRFQ96E11 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRRFQ96E11 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRRFQ96E11 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms