Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VTI1AQ96AJ9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms