Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.172e-6■■■■■ 59.4
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TBRG4Q969Z0 LSM5-201ENST00000223084 1295 ntTSL 212.44□□□□□ -0.422e-6■■■■■ 59.4
TBRG4Q969Z0 LINC00907-207ENST00000591381 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.752e-6■■■■■ 59.4
TBRG4Q969Z0 LSM5-202ENST00000409292 538 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.22e-6■■■■■ 59.4
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TBRG4Q969Z0 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.892e-6■■■■■ 59.4
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TBRG4Q969Z0 LINC00511-202ENST00000457958 1696 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.42e-7■■■■■ 59.3
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TBRG4Q969Z0 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.167e-13■■■■■ 58.8
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TBRG4Q969Z0 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.017e-13■■■■■ 58.8
TBRG4Q969Z0 TMEM205-206ENST00000586701 563 ntTSL 515.01□□□□□ -0.017e-13■■■■■ 58.8
TBRG4Q969Z0 TMEM205-209ENST00000588321 1310 ntTSL 514.91□□□□□ -0.027e-13■■■■■ 58.8
TBRG4Q969Z0 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.031e-6■■■■■ 58.8
TBRG4Q969Z0 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.041e-8■■■■■ 58.8
TBRG4Q969Z0 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.067e-13■■■■■ 58.8
TBRG4Q969Z0 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.077e-13■■■■■ 58.8
TBRG4Q969Z0 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.085e-7■■■■■ 58.8
TBRG4Q969Z0 SLC43A2-203ENST00000571376 623 ntTSL 314.53□□□□□ -0.081e-6■■■■■ 58.8
TBRG4Q969Z0 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.151e-8■■■■■ 58.8
TBRG4Q969Z0 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.171e-6■■■■■ 58.8
TBRG4Q969Z0 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.177e-13■■■■■ 58.8
TBRG4Q969Z0 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.199e-10■■■■■ 58.8
TBRG4Q969Z0 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.211e-8■■■■■ 58.8
TBRG4Q969Z0 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.211e-8■■■■■ 58.8
TBRG4Q969Z0 SPG11-203ENST00000535302 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.251e-8■■■■■ 58.8
TBRG4Q969Z0 IL1RAP-208ENST00000422625 534 ntTSL 413.49□□□□□ -0.257e-13■■■■■ 58.8
TBRG4Q969Z0 TRAF2-203ENST00000419057 709 ntTSL 313.41□□□□□ -0.261e-6■■■■■ 58.8
TBRG4Q969Z0 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.297e-13■■■■■ 58.8
TBRG4Q969Z0 SPG11-201ENST00000261866 7774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.321e-8■■■■■ 58.8
TBRG4Q969Z0 TRAF2-204ENST00000429509 823 ntTSL 312.91□□□□□ -0.341e-6■■■■■ 58.8
TBRG4Q969Z0 MRNIP-206ENST00000518950 558 ntTSL 412.79□□□□□ -0.361e-8■■■■■ 58.8
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